首先要解锁潜水能力，进入墓土沉船图往右侧地图深处飞找到港口，前方山洞里有个光圈，坐下等石碑全亮后鳐鲲会帮忙解锁潜水功能。解锁后水面会上升出现水下通道，操控方向键上滑上浮下滑下潜，记得关注氧气条并及时靠近蓝色泡泡补充。
深海季新增的鲸鱼神殿是必打卡点，完成任务需要音乐记忆技能。从起始点直走到传送门进入海底雕塑园，过桥沿右路找到神殿，按鲸鱼发出的音符弹奏琴键可解开机关。探索时记得完成三个谜题：记忆力挑战、指定位置互动和顺序触发机关，最终会遇见浮现的大鲸鱼，奖励包括潜水装备和星星。
云野海底宫殿需要特殊路线，从祭坛上方出口起飞，踩石块连续上升后左转跳下草坪即可到达。这里水光潋滟如同水晶宫，不需要潜水就能欣赏到海底星空效果。而深渊季的海底水族馆则需要先完成季节任务，学会潜水后配合矮人面具探索。水下探索时氧气条耗尽会掉翼，建议提前在雨林老奶奶挂机点储备能量。单人玩家推荐使用留影蜡烛记录美景，多人协作可用鲲灯摆爱心。遇到冥龙巡逻要迅速上浮，完成任务后别忘返回水面保存进度。
