开局最关键的抉择就是选择初始精灵，妙蛙种子、小火龙和杰尼龟各有特色。妙蛙种子是草/毒双属性，前期打岩石系道馆很轻松，但中期会遇到飞行系和火系克星；小火龙最终进化成喷火龙后实力强劲，但开局要熬过被岩石和水系克制的艰难阶段；杰尼龟作为水系防御优秀，通关过程相对平稳但缺乏爆发力。这个选择会影响你前中期至少10小时的游戏体验，必须慎重考虑。
小火龙虽然开局最难，但后期潜力最大。它的最终形态喷火龙拥有飞行属性，可以学习强力的火系和飞行系技能，速度种族值高达100，特攻也达到109，是通关后对战的好手。不过要注意前期在月见山和第一个岩石道馆会非常吃力，需要抓些辅助精灵比如波波或尼多朗来过渡。如果选择小火龙，建议在常磐森林多练级，把等级压制作为突破口。
它的藤鞭技能在前期就能打出稳定伤害，第一个岩石道馆可以轻松碾压，第二个水系道馆也能用草系技能造成克制伤害。中期学会催眠粉和毒粉后更是抓宠利器。不过到游戏后期，草/毒双属性会被越来越多精灵克制，需要搭配其他精灵组成队伍。妙蛙花虽然耐久不错，但缺乏爆发输出。
水属性打击面良好，防御种族值突出，进化成水箭龟后能抗能打。水系技能在中期对付岩石和地面系训练家时效果显著。缺点是输出节奏偏慢，遇到草系或电系对手时会陷入苦战。水箭龟可以学习冰系技能补充打击面，但需要后期才能获得相关技能机。记得在常磐森林抓一只皮卡丘。它的电系技能对后期飞行系和水系敌人非常有效，而且可爱的外表让它成为队伍中的吉祥物。绿毛虫也是值得培养的选择，进化成巴大蝴后能学会催眠粉和麻痹粉，是捕捉野生精灵的好帮手。开局选择没有绝对的对错，重要的是根据自己喜欢的战斗风格来决定。
