获取水之石的主要途径包括野外拾取、商店购买以及特定NPC赠送。水之石在火红版本中并非随处可见，需要玩家仔细探索地图或完成特定任务才能获得。水之石在野外通常以闪光道具的形式出现，玩家可以在游戏中的特定区域进行搜索。根据相关资料，水之石可能出现在霜抹山等寒冷地区的闪光点上，这些地点通常与水系宝可梦出没的区域重合。玩家在探索这些区域时应留意地面上的闪光点，使用调查功能进行检查。某些隐藏区域或洞穴深处也可能藏有水之石，建议玩家在探索时携带照明道具以便发现隐藏物品。
在游戏后期的某些特殊商店中，水之石可能会作为商品出售，价格通常在3000-5000游戏币之间。需这类商店往往需要玩家完成特定剧情或达到一定进度才会开放。部分城市的百货大楼高层也可能出售进化石，玩家可以定期检查商品更新情况。
与NPC互动也是获取水之石的方式之一。游戏中的某些支线任务或特殊挑战完成后，NPC会奖励玩家水之石作为报酬。在特定挑战中连续击败八位训练师后，有概率获得水之石奖励。部分隐藏NPC在满足特定条件后也会赠送进化石，建议玩家多与游戏中的角色对话，不要错过任何获取道具的机会。钓鱼小游戏和特殊活动同样可能产出水之石。在游戏中的钓鱼区域，使用高级钓竿并选择特定饵料时，有概率钓到装有进化石的宝箱。
