共有8个道馆分布在关都地区各主要城市，按照挑战顺序分别为尼比市岩石道馆、华蓝市水系道馆、枯叶市电系道馆、彩虹市草系道馆、金黄市超能力道馆、浅红市毒系道馆、红莲岛火系道馆以及常青市地面系道馆。每个道馆都有独特的机关设计和属性专精的馆主，需要玩家掌握对应的技能机器和属性克制策略才能顺利通过。
尼比市岩石道馆位于游戏初期必经之路，馆主小刚使用小拳石和大岩蛇组合，建议使用水系或草系技能快速解决。华蓝市水系道馆馆主小霞的海星星与宝石海星组合对电系技能极其脆弱。枯叶市电系道馆需要先在圣安奴号获得居合斩技能才能进入，其垃圾桶机关需连续触发两个正确开关才能开启馆主房间。彩虹市草系道馆被火箭队基地事件阻挡，需先完成游戏厅地下基地剧情。
金黄市超能力道馆位于西鲁夫公司总部附近，传送装置谜题需要按特定顺序触发。浅红市毒系道馆采用隐形墙设计，需通过触碰NPC辨别正确路径。红莲岛火系道馆要求玩家先解决岛屿南端的钥匙任务，废弃研究所内的机关门需要调整楼层开关才能获取道馆钥匙。常青市地面系道馆作为最终挑战，馆主坂木的穿山王与铁甲暴龙组合对水系和冰系技能抗性较低。
道馆挑战过程中需注意，部分道馆如金黄市和彩虹市存在剧情锁，必须完成火箭队相关事件才能解锁。枯叶市和红莲岛道馆需要分别掌握居合斩和冲浪技能才能抵达。建议在挑战前准备对应属性的强力宝可梦，并携带足够的状态恢复道具。每个道馆胜利后获得的徽章不仅能提升宝可梦能力上限，还是使用特定技能和进入宝可梦联盟的必要条件。
道馆之间的行进路线存在最优解，从华蓝市经地下通道可快速抵达枯叶市，彩虹市与金黄市通过地下通道相连。紫苑镇虽无道馆但作为交通枢纽，可通往多个关键区域。七岛区域在通关后开放，不包含主线道馆但提供额外挑战。建议按游戏内NPC指引顺序推进，避免因等级压制导致挑战困难。
