玩家常会遇到需要点亮雷元素方碑或石柱的谜题。这类解谜的核心在于掌握正确的点亮顺序和操作时机。以雷电将军传说任务中的三个雷柱子为例，使用九条裟罗或菲谢尔站在指定台子上，按照中间→右侧→中间（熄灭瞬间）→左侧的顺序依次激活，最终会触发雷丘丘王的出现，击败后即可完成任务。关键在于确保三根雷柱子同时亮起，操作速度要快。
稻妻地区的三角形石头解密是另一种常见谜题，其原理基于连锁反应机制。攻击左侧石柱会影响中间石柱的状态，使其与右侧石柱保持一致，再攻击右侧石柱则会使右侧两个石柱同步变化。根据不同初始状态存在27种解法组合，例如初始状态1.1.2时只需攻击左侧一次即可变为2.2.2，而1.2.3的初始状态需要先攻击左侧变为2.3.3，再攻击右侧两次达成2.2.2的统一状态。这类解谜需要观察石柱上的图案数量并进行对应次数的攻击。
荒海区域的神樱大祓任务涉及更复杂的雷属性方碑解谜。首先需要点亮井口周围的四座雷方碑启动机关，进入井内后使用留念镜观察三个地狐雕像显现隐藏机关。获取镇物后，需按照特定顺序调整结界内各石台上的勾玉数量，通常需要先处理地狐相关的机关，最后激活净化台。该解谜过程中会出现落武者敌人，建议提前准备爆发型队伍应对战斗环节。
对于稻妻的旋转石柱机关，解决方法是让所有石柱的朝向与中间石柱保持一致。通过站在中间石柱的不同方位观察，可以计算出需要攻击的具体石柱及其次数。数学上这是模4运算问题，每次攻击会影响相邻石柱的旋转角度，通过系统性的行变换可以推导出正确的操作序列。部分区域如珊瑚宫沙滩的雷元素方碑需要先解锁两个雷碑和一个水碑才能激活最终机关。
