三圣鸟是最容易找到的，急冻鸟藏在双子岛最深处，需要把岩石推下去堵住急流才能见到它；闪电鸟躲在无人发电站最里面，进去就能碰见；火焰鸟则在1号岛的灯火山顶等着咱们去挑战。超梦算是这个版本里最难抓的之一，它住在华蓝洞窟最底层，记得带上会冲浪和攀瀑的宝可梦，不然可到不了那里哦。
除了这些经典神兽，火红386还加入了更多稀有的小家伙。比如洛奇亚和凤王，它们分别藏在3号岛右边的草丛和1号岛下方的草丛里，不过遇到的概率比较低，得多转几圈。雪拉比则躲在3号岛左边的森林里，路过的时候记得多看看。三神柱也在这个版本里，岩神柱在1号岛上方的草地，冰神柱在双子岛，钢神柱则和闪电鸟一样待在无人发电站，抓它们的时候最好带上会特殊技能的宝可梦，不然可能会被耗很久。
还有一些水系和龙系的神兽也值得咱们去抓。盖欧卡可以用超级钓竿在双子岛钓到，而古拉顿则藏在1号岛火焰山的地下，需要仔细探索才能找到入口。裂空座出现在冠军之路的第二层，算是后期才能遇到的强力神兽。
代欧奇希斯和基拉祈也在这个版本里，前者在华蓝洞的复杂地形里游荡，后者则藏在2号岛的尽头，抓它们的时候记得多存档，免得一不小心让它们跑掉。抓神兽之前最好做好充分准备，比如多带些高级球和状态恢复药，有些神兽会使用逃跑技能，一旦没控住就可能前功尽弃。
