玩家需在游戏中期进入伯爵城堡的牢房区域，从骷髅腰部获取钥匙和药瓶，随后通过多点触控操作从骷髅脚部取得密码锁。密码通常与游戏内日期线索相关，例如0625或0616，输入正确后可打开机关门或宝箱。骷髅的互动设计需要玩家仔细观察其肢体细节，尤其是手部和脚部的隐藏触发点。
骷髅的另一用途出现在女巫墓穴的探索阶段。当玩家完成马龙的任务并获得扇贝肉后，需将骷髅头骨用于开启墓穴右侧石门。该门后藏有霜冻之刺和透镜修复材料，是推动剧情的关键。骷髅头骨与场景中的黏土符号结合，需配合锤子敲击才能完整获取道具。此环节要求玩家将此前收集的多个道具串联使用，例如油用于除锈、行星模型用于激活能量装置等。
在遗迹石像群场景中，骷髅碎片可与破布、玻璃组合成镜子，用于反射光线或解锁牢门。玩家需先在牢房内取得原木和木板，搭建临时通道后进入山洞区域。骷髅碎片在此处的拼图小游戏中起到连接线索的作用，其图案与转盘机关的符号完全一致，需通过旋转调整完成对应匹配才能获得钥匙。这一设计体现了道具的多阶段复用性。
游戏后期灯塔关卡中，骷髅作为能量载体再次出现。玩家需将从马龙处获得的骷髅放置于石台，配合霜冻之刺绘制三个特定符号。该环节包含一笔画小游戏，要求玩家根据柱面符号连续绘制完整图案，错误会导致能量中断。成功后会触发望远镜引导能量的动态谜题，骷髅转化为光源载体，其眼眶部位会投射出关键光束指向船长的船只位置。
